整个故事来源于一部最畅销并获过奖的热门电脑游戏：一个本不应该存在于这个世界上的王牌杀手，他是基因工程的智慧结晶，除了一个冷冰冰的称呼--“代号47”，没有人知道他出生于何处、来自于何方。但是你只要看过他，肯定会对他形于外的独特气质难以忘怀，那是一种致命的吸引力和近乎于优雅的残酷，只有可能出现在与孤独为伍的杀手身上。
　　“代号47”是一个神秘且复杂的男人，内心深处一直因为互相纠缠在一起的矛盾和否定而痛苦地挣扎着--虽然他是这个世界上最大的犯罪组织利用基因工程克隆出来的，却是由博爱的教会抚养长大的……所以对于他来说，也许存在的本身就是一种违背了生态平衡的错误。即使他很有才华、魅力超凡且非常迷人，但是他真正能够拥有的东西却是少之又少，连名字都成了一种奢望，而惟一能够确认他的身份的，似乎就只有后脑勺代表数字的两个条形码文身了。
　　杀人是“代号47”一直从事的的工作，他从未觉得夺走别人的生命有什么不妥，工作的时候也从不流露个人情感，坚定到令人发抖的决断力，让他以一种俯视的高傲态度看待着身边走马观花般变化的一切……他的生活就好像是一个不断重复的方程式，日复一日。然而，就算是智者也没办法掌握无常的命运，计划好的生命也有可能出现“偶然的概率”，“代号47”发现自己深埋已久的道德心突然开始活跃起来，一种从没体会过的陌生的情感波澜也浮上心头--而这一切变化，都发生在他遇见一个神秘的俄国女人后。